自2021年1月1日起波蘭國民教育部與科學高等教育部終止運作，由該兩部整併後的新設機關教育科學部於原址正式成立，首任部長為現任國會議員暨盧布林天主教大學教授Przemyslaw Czarnek。

國民教育部與科學高等教育部原有業務及內部單位由新設之教育科學部承接，賡續擘劃推動教育培育與高教科學等相關事務。當被問及整併後的影響及未來的部長辦公地點時，C部長表示，不會有所改變，視業務性質於Szucha大道（國民教育部原址）與Hoza大街（科學高等教育部原址）辦公室處理公務，並將合併執掌功能重疊之一級內部單位，例如國際合作司，而與原機關掌理事務（例如國民教育、科學高等教育）相涉之一級內部單位則個別設立。

目前教育科學部設置部長（Minister）1人、副部長（Wiceminister）4人、次長（Podsekretarz Stanu）1人、總主任（Dyrektor Generalny）1人，內部單位包括科學司、高等教育科學法律司、高等教育司、創新發展司、科研投資司、學校教育法規司、歐盟結構基金司、普通教育司、課程教材司、策略認證職業教育司、地方政府合作司、培育與融合教育司、國際合作司、部長室、政策顧問室、總主任室、預算財務處、資訊推廣處、控管審計處。